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大麦40K 液相SNP芯片及其在分子育种中的应用
行业领域:农、林、牧、渔业,农业 成...

2022-11-22

  基本信息

  合作方式: 技术转让

  成果类型: 发明专利

  行业领域:农、林、牧、渔业,农业

  成果介绍

  基于前期对全球155份不同类型大麦进行全基因组重测序获得的4000万个SNP位点,筛选出多态性好、代表性强、覆盖均匀的40519个SNP位点,利用GenoBaits技术开发了大麦特异的高通量40K SNP液相芯片。这是具有完全自主知识产权的世界首款大麦高密度液相SNP芯片,具有多态性高、特异性好、通用性强、检测方便、低成本、高通量、高灵敏度等优势,为大麦全基因组选择、分子育种等提供了重要工具,为突破大麦育种瓶颈、解决种业“卡脖子”问题奠定坚实基础。

  成果亮点

  本款SNP芯片的SNP位点信息的来源是来自本团队完成的155份不同类型大麦的重测序数据,数据代表性强,可信度高,填补了以前的大麦芯片没有野生大麦和青稞遗传信息的瓶颈,可以广泛应用于栽培大麦、野生大麦、青稞等各种不同类型大麦的相关研究,代表性强、通用性强。 2.本款芯片基于微流控液相芯片技术,克服了传统固相芯片需要设计探针而成本高的缺点,具有检测方便,具有低成本、高通量、高灵敏度以及并行检测等优势,可以灵活选择检测通量,即该款产品即可以检测40K个位点,也可以根据需求检测10K、20K、 30K等不同标记密度,做到了一款芯片,多种密度组合,经济、高效、实用性强。 主要技术指标: 1.不低于4万个SNP位点 2.均匀覆盖全基因组,每个染色体上的位点数均等 3.各个位点的最小等位基因频率(MAF)>0.3,缺失率(NA)<5%,杂合率<5%

  团队介绍

  西北农林科技大学是我国第一所由高校和科研单位合并组建的综合性全国重点大学,承担着为西部农业发展提供技术支撑和人才支持的重任。学校以提高科技创新能力为突破口,加强科研基地建设,努力提升科技创新水平和原始创新能力,使学校科研基地建设的数量、效益和能力得到较快发展。目前,学校拥有国家和省部级科研基地92个。其中国家和省部级重点实验室30个,国家和省部级工程(技术)研究中心40个,国家和省部级野外(科学)实验台站16个,省部级哲学社科研究中心6个。

  成果资料

 

产48.1

产48.2



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